虽然这个该地区已有五千多年的土著居民居住,直到1500年耶稣会传教士到达那里,该地区才被“文明化”。西班牙征服者弗朗西斯科·德·奥雷利亚纳(Francisco de Orellana)是第一个看亚马逊的白人。在顺着纳波河(RíoNapo)搜寻埃尔多拉多(埃尔多拉多)的旅途中,他遇到了一条大河,土著人民称其为“水之王”。在河边遭到女兵袭击后,他将其称为Amazonas。
大多数土著部落(在该地区发现了很多小部落:波拉斯,亚瓜斯和奥雷琼斯是最多的部落)已经放弃了他们传统的狩猎和采集方式,现在生活在大河沿岸的小社区中。除非您从伊基托斯远去,深入丛林,这是一个痛苦而危险的事业,否则您将不会看到偏远的部落。您将看到的是那些已经习惯了西式服装和其他设施,但仍然与自然和谐相处并保留了数千年传统的人们。一个常见的景象可能是一个渔夫在他的独木舟上平静地划在亚马逊河支流上,垂钓在其中许多可食用的鱼中。
很少有旅行者在马德雷德迪奥斯(Madre de Dios)部门的首府马尔多纳多港(Puerto Maldonado)中花费很多时间,而把这座城市作为前往坦波帕塔国家保护区的起点。马努生物圈保护区位于库斯科和马洛纳多港之间的马德雷德迪奥斯河上游,交通不便,但原始程度较高。尽管如此,坦波帕塔(Tambopata)不会令人失望,这些保护区之外的许多丛林仍然拥有非凡的动植物。